新型便攜式DNA測序儀可快速準(zhǔn)確地診斷小麥病毒

爆炸造成小麥作物的重大損失。最近，孟加拉國因南美小麥瘟病菌的入侵而遭受了破壞，該病在2016年首次在該國發(fā)生。該病蔓延至約15,000公頃(占該國耕種小麥面積的16%)，并導(dǎo)致產(chǎn)量損失高達(dá)100%。

作物病害的診斷至關(guān)重要，但傳統(tǒng)方法依靠病理學(xué)家的專業(yè)知識，而病理學(xué)家又要依靠疾病癥狀的物理外觀，這可能類似于其他因素(如營養(yǎng)缺乏或環(huán)境因素)造成的損害。病理學(xué)家在檢測不會感染植物地上部分的共感染和病原體方面也遇到困難。

此外，沒有現(xiàn)有的方法可以在爆發(fā)期間快速識別未知病原體，這在孟加拉國的小麥瘟病菌爆發(fā)期間就很明顯了。

堪薩斯州的一組科學(xué)家已經(jīng)開發(fā)出一種新技術(shù)，該技術(shù)可以以很高的準(zhǔn)確性快速識別麥田中的病毒。他們從堪薩斯州西部收集了四個小麥樣品，并使用了新的口琴大小的DNA測序儀和一個計算機(jī)程序來快速檢測樣品中的三種不同病毒。此外，他們的結(jié)果表明樣品中含有一種新的病毒株。

這些來自USDA-ARS和堪薩斯州立大學(xué)的科學(xué)家現(xiàn)在正在致力于改進(jìn)該技術(shù)，以便使其可以在現(xiàn)場應(yīng)用中使用。他們的研究發(fā)表在《植物病害》 9月號上的“使用納米孔測序技術(shù)在受感染的組織中鑒定小麥病毒”一文中，是有關(guān)使用新型便攜式DNA測序技術(shù)進(jìn)行小麥病毒鑒定的第一份報告。這些結(jié)果已廣泛應(yīng)用于動植物病害識別和現(xiàn)場診斷技術(shù)。